Enstitümüz 20.06.1926 tarih ve 403 sayılı Resmi Gazete de yayımlanan " 867 sayılı Ziraat Vekaletine Merbut Bazı Mektep ve Müesseselerin Sureti İdaresi " Kanunun ek 2.nci maddesine dayandırılarak çalıştırılmaya başlanmış, akabinde 01.02.1963 tarihli 170 sayılı Kanun Hükümlerine Tabii Enstitü, Kurumlar, Hayvan Hastaneleri ve İnekhanelere ait Görev ve İş Yönetmeliği düzenlemeleri çerçevesinde, ilk defa 1948 yılında, daha önce sığır vebası mücadelesinde serum deposu olarak kullanılan tek katlı, küçük ve ahşap bir binada "Samsun Veteriner Bölge Laboratuarı " adıyla faaliyete geçmiştir. Enstitümüz; Rize, Trabzon, Giresun, Ordu, Samsun, Sinop, Amasya, Tokat ve Sivas illerini içine alan geniş bir bölgede hayvan hastalıkları yönünden problemlerinin çözülmesi için Tarım Bakanlığı tarafından 1963 yılında Samsun'un Atakum mevkiinde ve Samsun-Ankara, Samsun-Sinop karayolları kavşağında her anlamda modern ve çeşitli Laboratuarları ihtiva eden Enstitümüzün inşasına başlanmış ve 1966 yılında Samsun Veteriner Bakteriyoloji ve Araştırma Enstitüsü olarak faaliyete geçmiştir. Bunu takip eden dönemlerde “Veteriner Kontrol ve Araştırma Enstitüsü”, “Hayvan Hastalıkları Araştırma Enstitüsü” adlarını almış ve kurumumuz Bakanlığımız Teşkilat ve Görevleri hakkındaki 183 ve 212 sayılı Kanun Hükmündeki Kararnameler ve bu kararnamelerce kabulü hakkındaki 06.03.1985 tarih ve 3161 sayılı Kanunla Araştırma birimleri olarak görev alanlarında çalışma ve etkinliklerine devam etmiştir. Son olarak da kurumumuz Bakanlığımızın 22.09.1994 tarih ve MKD – G /1 Sayılı OLUR' ları ile "Samsun Veteriner Kontrol ve Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü” adı altında bağlı illere hizmet vermeyi sürdürmektedir. Halen bünyesinde oniki laboratuarı ve bir Döner Sermaye İşletmesi Müdürlüğü bulunan Samsun Veteriner Kontrol ve Araştırma Enstitüsü ek binaları ve lojmanları ile beraber yaklaşık 45 dönüm üzerinde faaliyetlerini yürütmektedir.